随着徐勇等营纷纷接受条件，整编开始了。
左良玉大军对外号称几十万，但大多是被裹挟的百姓、其实真正的士兵人数，大概在4-5万人，一共15个总兵营。
其中马进忠、卢鼎、王允成三个营大约1万人，是此次收复九江的主要功臣。
令人意外的是，没有参与对抗，一直选择中立的金声恒，因为不甘心被降官职，反而选择了离开。
一同离开的还有徐勇、李国英、卢光祖、郝效忠四人。这5人离开后一路向北，投降了阿济格。
剩下的6个总兵里面，其中吴学礼、张应祥、张应元3人对广陵公主的身份依然存疑，但他们此时也并没有随金声恒等人北上降清，而是选择了南下，选择暂时观望。
而徐恩盛、常登、徐育贤3人，原本在九江反正过程中就选择中立，没有参与抵抗，也没有太大的野心，再加上他们3人营里仰慕广陵公主的将士众多，于是他们决定接受官降一级的条件，留了下来。
另外还有一个营，由于其总兵惠登相不久前病死，贞德把这个营交给了刘肇基。
贞德梳理了一下结果，15个总兵里面，一共走了8个，还剩下7个营。
走掉的8个营里面，有一部分官兵不愿意北上，留了下来，这部分人大约有5千人。加上留下的7个营，总兵力大约2万5千人左右。
贞德以广陵公主的身份，对这2万5千人进行了整编。
其中老弱病残淘汰了1万人，这些被淘汰的1万士兵，将会被分别安置到九江以及未来江西各州县，从事地方守备、基层官吏、后勤等工作。这一方面给了老弱和伤残士兵一个妥善的安置，另一方面，这些人也是未来贞德打造江西根据地的基层力量。
另外再在周边州县中，招募了1万2千名青壮年补充进军队，加上原本的1万5千精锐，合计有2万7千人。
这2万7千人随后被整编为9个营，其中：
1.刘肇基：骑兵营（3千人）
把全军大部分战马集中起来，以刘肇基本部400骑兵中的300人为核心，整合惠登相部精锐，加上从各营抽调的精锐骑兵，以及补充的新兵。
新的骑兵营大约3千人，是全军的精锐。
2.马进忠、卢鼎、王允成：马步营（各3千人，其中骑兵500，火铳兵500，步兵2000）
三人以各自本部兵马为核心，补充了新兵和武器装备之后，各领3千人。
3.徐恩盛、常登、徐育贤：步兵营（各2千人）
这三人各降一级，以副总兵的官职，各领2千人。
4.周天：水军营（3千人）
以带来的100金山好汉为核心，从各营抽调熟悉水性的士兵，加上新兵，编制了一个水军营，大约3千人。
话说这左梦庚父子也真是不容小觑，竟然打造了大小船只4万艘！当然，这里面大多数是小舢板，其实也就是在各地强征的渔船，不过大型战舰，也有上百条，而中型战船更是有数千条。
这些船只成为了后面贞德改变天下局势的关键，这是后话，暂时按下不表。
5.广陵公主：亲兵营（6千人，分为两个营：忠诚营和扬州营。其中每个营火铳兵1千，步兵1千5百，骑兵500。另有100骑公主卫队。）
对于走掉的8个总兵营留下的5千人如何安置，贞德一时有些头疼。
如果将这些人集中编制一个营，一来没有可信赖的将领统帅，二来这些人来自8个不同的营，难免内斗不团结，影响战斗力。
至于说分散到新编8个营安置呢，又怕他们被各营老兵欺负，毕竟他们的主将叛逃了。
思考再三，贞德决定把这5千人裁汰老弱后剩余的2千精锐，加上从马进忠、卢鼎、王允成三人那里借来的一些忠诚可信赖的老兵，补充新兵后，编成了一个忠诚营。
忠诚营3千人里面，有2千人原本是8个叛将下属，贞德把他们编入亲兵营，放在身边，也是希望赢得他们的信任，彻底收服他们的心。
不过，为了确保贞德的安全，刘肇基支援了100人精锐骑兵，周天也安排了10个可靠的好汉，组成了“公主卫队”，以防万一有人叛变的时候，保护贞德的安全。
在整编部队的过程中，何刚、柳如龙（仪真知县）等人一路保护数万扬州百姓抵达了江西，在地方官吏的安排下，分散到附近州县安置。
贞德特意从跟跟随自己逃来江西的扬州百姓里面，征募了2千5百名扬州籍士兵，又从其他总兵那里讨来了5百名可靠的骨干，编制了一个扬州营。与忠诚营合称公主亲兵营。两个亲兵营暂不设总兵，分别由3个参将各领1千人。统一归贞德指挥。
并且也给何刚的忠贯营补充了新兵，整编为第10营，以何刚为总兵。
就这样，整编后的九江城现有10营共3万兵马。
袁继咸是江西总督，于是回南昌统筹调度，协调江西各地准备应战。
在临走之前，贞德想起历史上江西之战一个着名的忠臣，兵部主事杨廷麟，于是拜托袁继咸启用杨廷麟，命他自行在赣州募集军队。
当然，贞德也没忘了打造军械、补充箭矢、粮草。毕竟十天后阿济格大军就会抵达九江，一场血战不可避免。
就这样，整个九江城在肃穆的气氛中，度过了十天时间，迎来了清太祖努尔哈赤第十二子，满清和硕英亲王——阿济格。
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